Maritime Pine Genomics in Focus - Université Clermont Auvergne
Chapitre D'ouvrage Année : 2022

Maritime Pine Genomics in Focus

1 Department of Plant Systems Biology, VIB, and Department of Plant Biotechnology and Bioinformatics
2 VIB - Vlaams Instituut voor Biotechnologie [Ghent, Belgique]
3 CSIC - Consejo Superior de Investigaciones Cientificas [España] = Spanish National Research Council [Spain]
4 INIA - Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria = National Institute for Agricultural and Food Research and Technology
5 UPM - Universidad Politécnica de Madrid
6 Universidad de Málaga [Málaga] = University of Málaga [Málaga]
7 BioGeCo - Biodiversité, Gènes & Communautés
8 UMR EGFV - Ecophysiologie et Génomique Fonctionnelle de la Vigne
9 IBET - Instituto de Biologia Experimental e Tecnológica
10 INIA-CISA - Centro de Investigacion en Sanidad Animal
11 UEFP - Unité expérimentale Forêt Pierroton
12 Georg-August-University = Georg-August-Universität Göttingen
13 ITQB - Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier
14 SILS - Swammerdam Institute for Life Sciences
15 UV - Universitat de València = University of Valencia
16 Faculdade de Ciências [Lisboa]
17 UAH - Universidad de Alcalá - University of Alcalá
18 CETEMAS - Forest and Wood Technology Research Centre
19 GDEC - Génétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales
20 Northern Arizona University [Flagstaff]
21 MBG - Mision Biologica de Galicia
22 FCBA - Institut Technologique Forêt Cellulose Bois-construction Ameublement
23 BioForA - Biologie intégrée pour la valorisation de la diversité des Arbres et de la Forêt
Annie Raffin
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  • PersonId : 1203105
María Dolores Vélez
  • Fonction : Auteur
Lorenzo Federico Manjarrez
  • Fonction : Auteur
María Belén Pascual
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1420917
Ana Alves
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1420918
Marta Callejas Díaz
  • Fonction : Auteur
María Ángeles Guevara
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1420921
Juan Majada
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1420922
Rafael Zas
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1049779
José Antonio Cabezas
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María Teresa Cervera
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  • PersonId : 1120583

Résumé

The advent of next-generation genome sequencing technologies has allowed approaching the sequencing and analysis of large and complex conifer genomes. Maritime pine (Pinus pinaster Ait.) is an economically and ecologically important conifer species widely distributed in South-West Europe, which shows a significant genetic and adaptive variability. This chapter takes on the task of reviewing the insights into the maritime pine genome sequencing breakthrough and its impact on downstream analysis. Maritime pine genome sequencing and assembly approaches are described along with the impact of related tools. A section of the state-of-the-art research on comparative, functional, structural, and translational genomics aimed at dissecting the genetic basis and the specific regulation of biological processes underlying the expression of traits of interest in maritime pine and other conifers is also described. Perspectives about the impact of these tools as well as additional research approaches are discussed.
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Dates et versions

hal-03594614 , version 1 (08-10-2024)

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Citer

Lieven Sterck, Nuria de María, Rafael A Cañas, Marina de Miguel, Pedro Perdiguero, et al.. Maritime Pine Genomics in Focus. The Pine Genomes, Springer International Publishing, pp.67-123, 2022, Compendium of Plant Genomes, 978-3-030-93390-6. ⟨10.1007/978-3-030-93390-6_5⟩. ⟨hal-03594614⟩
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