Large-Scale Recombinant Production of the SARS-CoV-2 Proteome for High-Throughput and Structural Biology Applications - Groupe Flexibilité et Dynamique des Protéines par RMN / Protein Dynamics and Flexibility by NMR Group (IBS-FDP)
Article Dans Une Revue Frontiers in Molecular Biosciences Année : 2021

Large-Scale Recombinant Production of the SARS-CoV-2 Proteome for High-Throughput and Structural Biology Applications

Nadide Altincekic , Sophie Marianne Korn , Nusrat Shahin Qureshi , Marie Dujardin , Martí Ninot-Pedrosa , Rupert Abele , Marie Jose Abi Saad , Caterina Alfano , Fabio C L Almeida , Islam Alshamleh , Gisele Cardoso de Amorim , Thomas K Anderson , Cristiane D Anobom , Chelsea Anorma , Jasleen Kaur Bains , Adriaan Bax , Martin Blackledge (1) , Julius Blechar , Anja Böckmann (2) , Louis Brigandat , Anna Bula , Matthias Bütikofer , Aldo R Camacho-Zarco (1) , Teresa Carlomagno , Icaro Putinhon Caruso , Betül Ceylan , Apirat Chaikuad , Feixia Chu , Laura Cole , Marquise G Crosby , Vanessa de Jesus , Karthikeyan Dhamotharan , Isabella C Felli , Jan Ferner , Yanick Fleischmann , Marie-Laure Fogeron , Nikolaos K Fourkiotis , Christin Fuks , Boris Fürtig , Angelo Gallo , Santosh L Gande , Juan Atilio Gerez , Dhiman Ghosh , Francisco Gomes-Neto , Oksana Gorbatyuk , Serafima Guseva (1) , Carolin Hacker , Sabine Häfner , Bing Hao , Bruno Hargittay , K Henzler-Wildman , Jeffrey C Hoch , Katharina F Hohmann , Marie T Hutchison , Kristaps Jaudzems , Katarina Jović , Janina Kaderli , Gints Kalniņš , Iveta Kaņepe , Robert N Kirchdoerfer , John Kirkpatrick , Stefan Knapp , Robin Krishnathas , Felicitas Kutz , Susanne Zur Lage , Roderick Lambertz , Andras Lang , Douglas Laurents , Lauriane Lecoq , Verena Linhard , Frank Löhr , Anas Malki (1) , Luiza Mamigonian Bessa (1) , Rachel W Martin , Tobias Matzel , Damien Maurin (1) , Seth W Mcnutt , Nathane Cunha Mebus-Antunes , Beat H Meier , Nathalie Meiser , Miguel Mompeán , Elisa Monaca , Roland Montserret , Laura Mariño Perez (1) , Celine Moser , Claudia Muhle-Goll , Thais Cristtina Neves-Martins , Xiamonin Ni , Brenna Norton-Baker , Roberta Pierattelli , Letizia Pontoriero , Yulia Pustovalova , Oliver Ohlenschläger , Julien Orts , Andrea T da Poian , Dennis J Pyper , Christian Richter , Roland Riek , Chad M Rienstra , Angus Robertson , Anderson S Pinheiro , Raffaele Sabbatella , Nicola Salvi (1) , Krishna Saxena , Linda Schulte , Marco Schiavina , Harald Schwalbe , Mara Silber , Marcius da Silva Almeida , Marc A Sprague-Piercy , Georgios A Spyroulias , Sridhar Sreeramulu , Jan-Niklas Tants , Kaspars Tārs , Felix Torres , Sabrina Töws , Miguel Á Treviño , Sven Trucks , Aikaterini C Tsika , Krisztina Varga , Ying Wang , Marco E Weber , Julia E Weigand , Christoph Wiedemann , Julia Wirmer-Bartoschek , Maria Alexandra Wirtz Martin , Johannes Zehnder , Martin Hengesbach , Andreas Schlundt
Nadide Altincekic
  • Fonction : Auteur
Sophie Marianne Korn
  • Fonction : Auteur
Nusrat Shahin Qureshi
  • Fonction : Auteur
Marie Dujardin
  • Fonction : Auteur
Martí Ninot-Pedrosa
  • Fonction : Auteur
Rupert Abele
  • Fonction : Auteur
Marie Jose Abi Saad
  • Fonction : Auteur
Caterina Alfano
  • Fonction : Auteur
Fabio C L Almeida
  • Fonction : Auteur
Islam Alshamleh
  • Fonction : Auteur
Gisele Cardoso de Amorim
  • Fonction : Auteur
Thomas K Anderson
  • Fonction : Auteur
Cristiane D Anobom
  • Fonction : Auteur
Chelsea Anorma
  • Fonction : Auteur
Jasleen Kaur Bains
  • Fonction : Auteur
Adriaan Bax
  • Fonction : Auteur
Martin Blackledge
Julius Blechar
  • Fonction : Auteur
Louis Brigandat
  • Fonction : Auteur
Anna Bula
  • Fonction : Auteur
Matthias Bütikofer
  • Fonction : Auteur
Teresa Carlomagno
  • Fonction : Auteur
Icaro Putinhon Caruso
  • Fonction : Auteur
Betül Ceylan
  • Fonction : Auteur
Apirat Chaikuad
  • Fonction : Auteur
Feixia Chu
  • Fonction : Auteur
Laura Cole
  • Fonction : Auteur
Marquise G Crosby
  • Fonction : Auteur
Vanessa de Jesus
  • Fonction : Auteur
Karthikeyan Dhamotharan
  • Fonction : Auteur
Isabella C Felli
  • Fonction : Auteur
Jan Ferner
  • Fonction : Auteur
Yanick Fleischmann
  • Fonction : Auteur
Marie-Laure Fogeron
Nikolaos K Fourkiotis
  • Fonction : Auteur
Christin Fuks
  • Fonction : Auteur
Boris Fürtig
  • Fonction : Auteur
Angelo Gallo
  • Fonction : Auteur
Santosh L Gande
  • Fonction : Auteur
Juan Atilio Gerez
  • Fonction : Auteur
Dhiman Ghosh
  • Fonction : Auteur
Francisco Gomes-Neto
  • Fonction : Auteur
Oksana Gorbatyuk
  • Fonction : Auteur
Serafima Guseva
Carolin Hacker
  • Fonction : Auteur
Sabine Häfner
  • Fonction : Auteur
Bing Hao
  • Fonction : Auteur
Bruno Hargittay
  • Fonction : Auteur
K Henzler-Wildman
  • Fonction : Auteur
Jeffrey C Hoch
  • Fonction : Auteur
Katharina F Hohmann
  • Fonction : Auteur
Marie T Hutchison
  • Fonction : Auteur
Kristaps Jaudzems
  • Fonction : Auteur
Katarina Jović
  • Fonction : Auteur
Janina Kaderli
  • Fonction : Auteur
Gints Kalniņš
  • Fonction : Auteur
Iveta Kaņepe
  • Fonction : Auteur
Robert N Kirchdoerfer
  • Fonction : Auteur
John Kirkpatrick
  • Fonction : Auteur
Stefan Knapp
  • Fonction : Auteur
Robin Krishnathas
  • Fonction : Auteur
Felicitas Kutz
  • Fonction : Auteur
Susanne Zur Lage
  • Fonction : Auteur
Roderick Lambertz
  • Fonction : Auteur
Andras Lang
  • Fonction : Auteur
Douglas Laurents
  • Fonction : Auteur
Lauriane Lecoq
  • Fonction : Auteur
Verena Linhard
  • Fonction : Auteur
Frank Löhr
  • Fonction : Auteur
Anas Malki
Rachel W Martin
  • Fonction : Auteur
Tobias Matzel
  • Fonction : Auteur
Seth W Mcnutt
  • Fonction : Auteur
Nathane Cunha Mebus-Antunes
  • Fonction : Auteur
Beat H Meier
Nathalie Meiser
  • Fonction : Auteur
Miguel Mompeán
  • Fonction : Auteur
Elisa Monaca
  • Fonction : Auteur
Roland Montserret
Celine Moser
  • Fonction : Auteur
Claudia Muhle-Goll
  • Fonction : Auteur
Thais Cristtina Neves-Martins
  • Fonction : Auteur
Xiamonin Ni
  • Fonction : Auteur
Brenna Norton-Baker
  • Fonction : Auteur
Roberta Pierattelli
  • Fonction : Auteur
Letizia Pontoriero
  • Fonction : Auteur
Yulia Pustovalova
  • Fonction : Auteur
Oliver Ohlenschläger
  • Fonction : Auteur
Julien Orts
  • Fonction : Auteur
Andrea T da Poian
  • Fonction : Auteur
Dennis J Pyper
  • Fonction : Auteur
Christian Richter
  • Fonction : Auteur
Roland Riek
  • Fonction : Auteur
Chad M Rienstra
  • Fonction : Auteur
Angus Robertson
  • Fonction : Auteur
Anderson S Pinheiro
  • Fonction : Auteur
Raffaele Sabbatella
  • Fonction : Auteur
Nicola Salvi
Krishna Saxena
  • Fonction : Auteur
Linda Schulte
  • Fonction : Auteur
Marco Schiavina
  • Fonction : Auteur
Harald Schwalbe
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1112379
Mara Silber
  • Fonction : Auteur
Marcius da Silva Almeida
  • Fonction : Auteur
Marc A Sprague-Piercy
  • Fonction : Auteur
Georgios A Spyroulias
  • Fonction : Auteur
Sridhar Sreeramulu
  • Fonction : Auteur
Jan-Niklas Tants
  • Fonction : Auteur
Kaspars Tārs
  • Fonction : Auteur
Felix Torres
  • Fonction : Auteur
Sabrina Töws
  • Fonction : Auteur
Miguel Á Treviño
  • Fonction : Auteur
Sven Trucks
  • Fonction : Auteur
Aikaterini C Tsika
  • Fonction : Auteur
Krisztina Varga
  • Fonction : Auteur
Ying Wang
Marco E Weber
Julia E Weigand
  • Fonction : Auteur
Christoph Wiedemann
  • Fonction : Auteur
Julia Wirmer-Bartoschek
  • Fonction : Auteur
Maria Alexandra Wirtz Martin
  • Fonction : Auteur
Johannes Zehnder
Martin Hengesbach
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1112380
Andreas Schlundt
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1112381

Résumé

The highly infectious disease COVID-19 caused by the Betacoronavirus SARS-CoV-2 poses a severe threat to humanity and demands the redirection of scientific efforts and criteria to organized research projects. The international COVID19-NMR consortium seeks to provide such new approaches by gathering scientific expertise worldwide. In particular, making available viral proteins and RNAs will pave the way to understanding the SARS-CoV-2 molecular components in detail. The research in COVID19-NMR and the resources provided through the consortium are fully disclosed to accelerate access and exploitation. NMR investigations of the viral molecular components are designated to provide the essential basis for further work, including macromolecular interaction studies and high-throughput drug screening. Here, we present the extensive catalog of a holistic SARS-CoV-2 protein preparation approach based on the consortium’s collective efforts. We provide protocols for the large-scale production of more than 80% of all SARS-CoV-2 proteins or essential parts of them. Several of the proteins were produced in more than one laboratory, demonstrating the high interoperability between NMR groups worldwide. For the majority of proteins, we can produce isotope-labeled samples of HSQC-grade. Together with several NMR chemical shift assignments made publicly available on covid19-nmr.com, we here provide highly valuable resources for the production of SARS-CoV-2 proteins in isotope-labeled form. Introduction
Fichier principal
Vignette du fichier
Altincekic et al. - 2021 - Large-Scale Recombinant Production of the SARS-CoV.pdf (3.69 Mo) Télécharger le fichier
Origine Fichiers éditeurs autorisés sur une archive ouverte

Dates et versions

hal-03366994 , version 1 (06-10-2021)

Identifiants

Citer

Nadide Altincekic, Sophie Marianne Korn, Nusrat Shahin Qureshi, Marie Dujardin, Martí Ninot-Pedrosa, et al.. Large-Scale Recombinant Production of the SARS-CoV-2 Proteome for High-Throughput and Structural Biology Applications. Frontiers in Molecular Biosciences, 2021, 8, pp.653148. ⟨10.3389/fmolb.2021.653148⟩. ⟨hal-03366994⟩
329 Consultations
47 Téléchargements

Altmetric

Partager

More