Study of the transferability of microsatellite markers derived from bread wheat (T. aestivum) or rice ( O. sativa) ESTs (EST-SSRs) to their close and wild relative and evaluation of their potential for the organisation of genetic resources in the grass family
Etude de la portabilité de marqueurs microsatellites issus d'EST de blé tendre ( T. aestivum) ou de riz ( O. sativa) vers des espèces apparentés et évaluation de leur intérêt pour la structuration des ressources génétiques chez les graminées
Résumé
Le premier objetif de cette thèse a été de développer de nouveaux marqueurs moléculaires utilisables sur le blé et transférables vers un nombre important d'espèces cultivées ou sauvages de graminées. Nous avons observé une portabilité des EST-SSR excellente pour les sous espèces de blé qui diminue avec l'éloignement phylogénétique pour atteindre encore près de 30% avec le riz. Le deuxième objectif de cette thèse était d'exploiter les EST-SSR montrant une bonne portabilité pour valider leur capacité dans le cadre d'analyses phylogénétiques chez les Triticés et les graminées. Les résultats confirment que les espèces T. monococcum ssp urartu, Ae. speltoides et Ae tauschii sont respectivement apparentées aux donneurs des génomes A,B et D du blé tendre. Nous pouvons donc conclure que les EST-SSR sont des marqueurs intéressants et puissants pour étudier les espèces sauvages orphelines et pour faire des analyses phylogénétiques chez les graminées